Автомеханическое отделение стало самостоятельным структурным подразделением в 2009 году. Обучать же техников по ремонту и обслуживанию автотранспорта начали еще в 1997 году на судомеханическом отделении.

Сегодня специальность «Техническое обслуживание и ремонт автомобильного транспорта» входит в ТОП-50 наиболее востребованных и перспективных профессий на российском рынке труда.

Во время обучения студентов привлекают к участию в исследовательских проектах, научно-технических конференциях и областных конкурсах профмастерства. Так, полученные профессиональные навыки по ремонту и обслуживанию легковых автомобилей студенты могут продемонтсрировать, участвуя в Открытом региональном чемпионате «Молодые профессионалы» (WORLDSKILLS RUSSIA).

В 2012 году началась подготовка логистов. Специальность «Организация перевозок и управление на транспорте (по видам)» также является одной из перспективных специальностей для Калининградской области. Студенты получают знания не только о морских перевозках, но и об организации грузопотоков и пассажироперевозок в других логистических системах, о процессах организации и управления эксплуатационной деятельностью пассажирского и грузового транспорта, применении современных информационных технологий в управлении перевозками всех видов транспорта, изучают английский (в том числе морской) язык.

Учитывая географическое расположение региона и его транспортную специфику, выпускники автомеханического отделения были, остаются и будут востребованными. Ребята находят себя в работе в фирмах по ремонту легковых и грузовых машин, центрах сервисного обслуживания, автопарках, дилерских, складских, транспортно-логистических и транспортно-экспедиционных компаниях, на производственных предприятиях и заводах, в других организациях.